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华大基因为何无法用云替代超算?

责任编辑:editor04 作者:老凉 |来源:企业网D1Net  2014-12-16 22:37:12 本文摘自:百度百家

摘要 : 二者不是谁打败谁。没有超算完成大规模的基础科学研究和计算密集型的工作,云计算也不可能给合作伙伴和用户交付有价值的东西。

在上周五(12月12日)召开的2014年度亚马逊AWS技术峰会上,华大科技副总裁陈钢上台为AWS做证言称,由于广州和天津两大超算中心并不完全针对to C业务,而且没有本地存储,所以华大正在往云平台上迁移。陈钢的证言,被业内解读为华大基因正在抛弃高性能计算。

今日,华大科技方面专程通过《在前线》对这一观点做了反馈和澄清。

陈钢在接受《在前线》采访时详细地介绍了华大科技在IT方面的布局,他指出,在高性能计算和云计算方面,华大科技有清晰的战略,这两者都占有举足轻重的作用。

华大基因被妖魔化?

华大科技是华大基因的子公司,而华大基因是全球知名的生命科学研究机构、全球最大的基因组学研究机构,全球顶尖的三家基因组研究机构之一,另外两家是美国的Broad和英国的Sanger。

近年来,中国的高性能计算水平逐年提升,来自中国的超级计算机系统成为全球超级计算机TOP 500排行榜的常客。

由于高性能计算多用在科研、军事、能源、生命科学等要害部门和行业领域,因而各个国家都对高性能计算持续投入,近年来,中国已经成为继美国、日本等发达国家之后冉冉升起的高性能计算领域新星。

陈钢介绍说,国家对生命科学研究方面给予了大力支持。由于有国家超算中心的大力支持,华大基因在计算资源和技术支持都能够得到很好的保证。

说到这里,问题来了,华大基因既然并不缺资源,为何还要使用云计算?

之所以采用云计算,一方面是基因科学领域的不断发展导致的,另外是有具体的原因。

陈钢解释说,大量计算密集型的工作在超算中心和华大自己的数据中心完成后,需要将结果交付给合作伙伴和分支机构。以前的做法是大量使用FTP和快递硬盘。但是相比之下,如今云计算有着遍布各地的数据中心,显然这是一个更好的解决方案。

另外,基因组学的科学研究成果需要大量地转化为应用,华大为全球用户提供服务时,自建机房显然不是最佳选择。因此,华大需要云计算,尤其是在海外需求更强烈。

陈钢强调说,需要指出的是,云计算并不是要替代超算以及自己的数据中心。没有超算完成大规模的基础科学研究和计算密集型的工作,云计算也不可能给合作伙伴和用户交付有价值的东西。

高性能计算和云计算缺一不可

据陈钢介绍,华大基因在IT方面的需求主要来自三个方面,第一个是基础研究中的大规模计算,例如大规模的肠道菌群宏基因组研究,计算量非常大,同时需要用到CPU和GPU;大规模基因组的组装工作,计算复杂度高,需要不断的探索和调整算法及算法的参数,例如最近刚刚发表的鸟类基因组和进化分析的研究成果。

这一部分需求由华大自己的数据中心和国家超算中心来满足,其中计算密集型的项目大量使用国家超算中心资源。

第二方面的需求是致力于完成百万人类基因组项目所需的存储和计算资源。目前满足这方面需求的方案,还在规划当中。

第三方面的需求是为华大基因的全球用户消费者交付数据和分析结果。满足这方面的需求,之前是使用华大位于深圳、香港、武汉的自有数据中心。目前正在向以AWS为代表的公有云迁移。

陈钢补充说,“为了完成这个迁移,更重要是为了能以华大产生的海量基因组数据为基础构建起全球的基因组学研究平台,我们正在共有云上分别开发面向科学研究、临床诊断,个人基因组等不同类型用户的系统和应用。”

陈钢谈到的这一点,正是在AWS技术峰会上引发业界议论的结点所在。“我们并没有像外界所说的那样,抛弃高性能计算,更没有全面都扑到云计算上面,而是有清晰的战略和布局。”

据悉,华大科技在数据交付方面,长期跟AWS有业务往来,但规模并不大。从去年开始,随着华大开始构建基于云计算的生物数据分析平台,以及AWS进入中国,其与AWS的业务开始有了大幅增长。

如今,华大科技正在积极拓展海外市场,随着云计算生物信息平台逐步的完善和在海外市场的推出,与AWS合作的业务量也在加速。

亚马逊AWS如今是全球最大的公有云服务提供商,于2013年12月份AWS宣布在中国启动测试版,当时华大基因就是AWS在中国的首批用户。

陈钢表示,在为华大基因服务时,AWS安排了客户经理和技术团队,为华大全球业务提供技术支持,从深圳、香港到加州,都可以快速地得到响应和支持。

在本次技术峰会上,AWS发布了“AWS云创计划”(AWS Activate),并携手重庆市政府建立AWS在中国的第三个联合孵化器。“AWS云创计划”是一个全球性创业加速扶持计划,可以提供的支持包括最高可达人民币10万的AWS服务抵扣券、技术培训、创业公司专项活动以及内容广泛的开发者支持。

关键字:华大云创AWS

本文摘自:百度百家

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责任编辑:editor04 作者:老凉 |来源:企业网D1Net  2014-12-16 22:37:12 本文摘自:百度百家

摘要 : 二者不是谁打败谁。没有超算完成大规模的基础科学研究和计算密集型的工作,云计算也不可能给合作伙伴和用户交付有价值的东西。

在上周五(12月12日)召开的2014年度亚马逊AWS技术峰会上,华大科技副总裁陈钢上台为AWS做证言称,由于广州和天津两大超算中心并不完全针对to C业务,而且没有本地存储,所以华大正在往云平台上迁移。陈钢的证言,被业内解读为华大基因正在抛弃高性能计算。

今日,华大科技方面专程通过《在前线》对这一观点做了反馈和澄清。

陈钢在接受《在前线》采访时详细地介绍了华大科技在IT方面的布局,他指出,在高性能计算和云计算方面,华大科技有清晰的战略,这两者都占有举足轻重的作用。

华大基因被妖魔化?

华大科技是华大基因的子公司,而华大基因是全球知名的生命科学研究机构、全球最大的基因组学研究机构,全球顶尖的三家基因组研究机构之一,另外两家是美国的Broad和英国的Sanger。

近年来,中国的高性能计算水平逐年提升,来自中国的超级计算机系统成为全球超级计算机TOP 500排行榜的常客。

由于高性能计算多用在科研、军事、能源、生命科学等要害部门和行业领域,因而各个国家都对高性能计算持续投入,近年来,中国已经成为继美国、日本等发达国家之后冉冉升起的高性能计算领域新星。

陈钢介绍说,国家对生命科学研究方面给予了大力支持。由于有国家超算中心的大力支持,华大基因在计算资源和技术支持都能够得到很好的保证。

说到这里,问题来了,华大基因既然并不缺资源,为何还要使用云计算?

之所以采用云计算,一方面是基因科学领域的不断发展导致的,另外是有具体的原因。

陈钢解释说,大量计算密集型的工作在超算中心和华大自己的数据中心完成后,需要将结果交付给合作伙伴和分支机构。以前的做法是大量使用FTP和快递硬盘。但是相比之下,如今云计算有着遍布各地的数据中心,显然这是一个更好的解决方案。

另外,基因组学的科学研究成果需要大量地转化为应用,华大为全球用户提供服务时,自建机房显然不是最佳选择。因此,华大需要云计算,尤其是在海外需求更强烈。

陈钢强调说,需要指出的是,云计算并不是要替代超算以及自己的数据中心。没有超算完成大规模的基础科学研究和计算密集型的工作,云计算也不可能给合作伙伴和用户交付有价值的东西。

高性能计算和云计算缺一不可

据陈钢介绍,华大基因在IT方面的需求主要来自三个方面,第一个是基础研究中的大规模计算,例如大规模的肠道菌群宏基因组研究,计算量非常大,同时需要用到CPU和GPU;大规模基因组的组装工作,计算复杂度高,需要不断的探索和调整算法及算法的参数,例如最近刚刚发表的鸟类基因组和进化分析的研究成果。

这一部分需求由华大自己的数据中心和国家超算中心来满足,其中计算密集型的项目大量使用国家超算中心资源。

第二方面的需求是致力于完成百万人类基因组项目所需的存储和计算资源。目前满足这方面需求的方案,还在规划当中。

第三方面的需求是为华大基因的全球用户消费者交付数据和分析结果。满足这方面的需求,之前是使用华大位于深圳、香港、武汉的自有数据中心。目前正在向以AWS为代表的公有云迁移。

陈钢补充说,“为了完成这个迁移,更重要是为了能以华大产生的海量基因组数据为基础构建起全球的基因组学研究平台,我们正在共有云上分别开发面向科学研究、临床诊断,个人基因组等不同类型用户的系统和应用。”

陈钢谈到的这一点,正是在AWS技术峰会上引发业界议论的结点所在。“我们并没有像外界所说的那样,抛弃高性能计算,更没有全面都扑到云计算上面,而是有清晰的战略和布局。”

据悉,华大科技在数据交付方面,长期跟AWS有业务往来,但规模并不大。从去年开始,随着华大开始构建基于云计算的生物数据分析平台,以及AWS进入中国,其与AWS的业务开始有了大幅增长。

如今,华大科技正在积极拓展海外市场,随着云计算生物信息平台逐步的完善和在海外市场的推出,与AWS合作的业务量也在加速。

亚马逊AWS如今是全球最大的公有云服务提供商,于2013年12月份AWS宣布在中国启动测试版,当时华大基因就是AWS在中国的首批用户。

陈钢表示,在为华大基因服务时,AWS安排了客户经理和技术团队,为华大全球业务提供技术支持,从深圳、香港到加州,都可以快速地得到响应和支持。

在本次技术峰会上,AWS发布了“AWS云创计划”(AWS Activate),并携手重庆市政府建立AWS在中国的第三个联合孵化器。“AWS云创计划”是一个全球性创业加速扶持计划,可以提供的支持包括最高可达人民币10万的AWS服务抵扣券、技术培训、创业公司专项活动以及内容广泛的开发者支持。

关键字:华大云创AWS

本文摘自:百度百家

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