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大数据分析揭示卵巢癌治疗的新靶点

责任编辑:cres 作者:Riken |来源:企业网D1Net  2024-01-15 15:16:34 原创文章 企业网D1Net

卵巢癌是影响女性生殖系统的最具挑战性的癌症之一,其中高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最致命的。与许多其他类型的癌症一样,这种类型的癌症不是由单一突变驱动的,这使得它更难治疗,正因为如此,由理研高级智能项目中心(AIP)和日本国家癌症中心研究所的Hidnowi Machino领导的研究人员没有研究DNA序列,而是专注于表观遗传学特征——特定细胞类型中影响基因表达的开/关开关,在这种情况下,它会导致肿瘤形成。
 
HGSOC起源于输卵管,最困难的病例是对化疗无反应。研究人员使用来自人输卵管上皮细胞的细胞瞄准了这种类型的肿瘤,他们在不同的条件下生长,并使用特殊的综合组学分析进行研究。
 
Machino说:“这项分析集成并分析了来自多种高通量技术的海量数据,包括ATAC、芯片和RNA测序,以获得对复杂生物系统的整体理解。”
 
这项多组学分析预测,当细胞从正常转变为癌症时,控制基因表达的特定因素在肿瘤发生过程中表现异常,这些预测是通过比较正常细胞和癌细胞之间的蛋白质水平来检验的。
 
预测成立,研究人员发现,某些蛋白质,即AP-1复合体,在癌细胞中过度活跃,这些蛋白质在刺激癌细胞的生长和扩散方面发挥了作用。此外,另一组蛋白质,GATA家族,通常有助于控制细胞行为,被发现在癌细胞中效果较差。
 
分析还确定了在控制癌症生长方面发挥关键作用的特定基因-MAF、GATA6和DAB2。在肿瘤发生的早期,这些基因在表观遗传上受到抑制,导致肿瘤的形成。通过了解抑制这些基因是如何导致功能障碍的,研究人员能够推断出一种对策。
 
“我们意识到罪魁祸首是表观基因抑制导致的RAS过度激活,”Machino说,“并推断一种可以阻断这一途径的药物将逆转这一趋势。”
 
当用曲美替尼进行测试时,他们观察到了正常表观遗传控制的迹象,包括MAF和DAB2的解除抑制。曲美替尼是一种临床适用的药物,可以抑制RAS信号。
 
像曲美替尼这样的药物被称为MEK抑制剂,这项研究预测,它们可能在预防卵巢癌的肿瘤形成方面有效。此外,被抑制的MAF、GATA6和DAB2可能是有用的生物标志物。
 
“我们发现的HGSOC生物标记物有可能用于卵巢癌的早期检测,”Machino说,“这些发现还指出了新的治疗方法,这可能会对社会产生重大影响。”
 
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卵巢癌是影响女性生殖系统的最具挑战性的癌症之一,其中高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最致命的。与许多其他类型的癌症一样,这种类型的癌症不是由单一突变驱动的,这使得它更难治疗,正因为如此,由理研高级智能项目中心(AIP)和日本国家癌症中心研究所的Hidnowi Machino领导的研究人员没有研究DNA序列,而是专注于表观遗传学特征——特定细胞类型中影响基因表达的开/关开关,在这种情况下,它会导致肿瘤形成。
 
HGSOC起源于输卵管,最困难的病例是对化疗无反应。研究人员使用来自人输卵管上皮细胞的细胞瞄准了这种类型的肿瘤,他们在不同的条件下生长,并使用特殊的综合组学分析进行研究。
 
Machino说:“这项分析集成并分析了来自多种高通量技术的海量数据,包括ATAC、芯片和RNA测序,以获得对复杂生物系统的整体理解。”
 
这项多组学分析预测,当细胞从正常转变为癌症时,控制基因表达的特定因素在肿瘤发生过程中表现异常,这些预测是通过比较正常细胞和癌细胞之间的蛋白质水平来检验的。
 
预测成立,研究人员发现,某些蛋白质,即AP-1复合体,在癌细胞中过度活跃,这些蛋白质在刺激癌细胞的生长和扩散方面发挥了作用。此外,另一组蛋白质,GATA家族,通常有助于控制细胞行为,被发现在癌细胞中效果较差。
 
分析还确定了在控制癌症生长方面发挥关键作用的特定基因-MAF、GATA6和DAB2。在肿瘤发生的早期,这些基因在表观遗传上受到抑制,导致肿瘤的形成。通过了解抑制这些基因是如何导致功能障碍的,研究人员能够推断出一种对策。
 
“我们意识到罪魁祸首是表观基因抑制导致的RAS过度激活,”Machino说,“并推断一种可以阻断这一途径的药物将逆转这一趋势。”
 
当用曲美替尼进行测试时,他们观察到了正常表观遗传控制的迹象,包括MAF和DAB2的解除抑制。曲美替尼是一种临床适用的药物,可以抑制RAS信号。
 
像曲美替尼这样的药物被称为MEK抑制剂,这项研究预测,它们可能在预防卵巢癌的肿瘤形成方面有效。此外,被抑制的MAF、GATA6和DAB2可能是有用的生物标志物。
 
“我们发现的HGSOC生物标记物有可能用于卵巢癌的早期检测,”Machino说,“这些发现还指出了新的治疗方法,这可能会对社会产生重大影响。”
 
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